Pada tahun 2001 wacana pembentukan Kecamatan Pondokmelati pun mulai dibahas, rencananya beberapa kelurahan di wilayah selatan Kecamatan Pondokgede akan menjadi wilayah Kecamatan Pondokmelati.

Kecamatan Pondokmelati menjadi Kecamatan terakhir yang dimekarkan dari Pondokgede. Akhirnya, pada 2005 berdasarkan Perda Kota Bekasi Nomor 03 Tahun 2005 Tentang Perubahan Pertama Perda Kota Bekasi Nomor 04 Tahun 2004 Tentang Pembentukan Wilayah Administratif Kecamatan dan Kelurahan Kota Bekasi, secara definitif Kecamatan Pondokmelati berdiri.

Diwilayah Kecamatan ini terdapat daerah Jatimurni yang cukup dikenal dengan kerukunan umat beragamanya. Hal itu ditunjukkan dengan adanya Gereja Katholik, Gereja Kristen Pasundan dan Masjid yang letaknya saling berdekatan didukung dengan warga yang mampu menjaga toleransi.

Luas wilayah Kecamatan Pondok Melati adalah 1.179.925 Ha yang terdiri dari 4 kelurahan yaitu :

Kelurahan Jatirahayu : 312,425 Ha

Kelurahan Jatiwarna : 248,000 Ha

Kelurahan Jatimelati : 316,000 Ha

Kelurahan Jatimurni : 300,500 Ha Sebelah Selatan

: Kecamatan Jatisampurna